区市场采购贸易服务中心设2个内设机构。

　　一、综合部

　　承担文电、会务、机要、档案、督办、财务、后勤等日常工作；承担社会治安综合治理、计生、信访、信息公开等工作；负责本单位的政治思想建设、组织建设、作风建设和纪律检查工作；负责干部职工的普法教育工作；负责试验区运作经费的预算、决算编制、预算编制执行及账目处理；统筹试验区的经济运作和资金收支等保障服务。

　　二、协调服务部

　　承担跨境电商试验区建设、市场采购贸易方式试点、大众创业、万众创新等工作的调研及跟踪落实；承担试验区范围内的资源整合、整体规划建设；负责协调海关、地税、国税、检验检疫、边检、海事、港务等单位的有关工作；承担全区有关国际贸易的统筹协调，汇总收集国际贸易动态，为区领导决策提供建议；承担指导试验区内企业的报关，为企业提供通关配套服务；承担试验区内企业的服务保障工作。